Une vaste analyse portant sur des milliers de souches de bactéries de la tuberculose a découvert de nouveaux gènes liés à la résistance aux antibiotiques – des découvertes qui pourraient jouer un rôle crucial dans le futur traitement et la prévention de la tuberculose, et la lutte contre les microbes résistants aux médicaments.
À l’heure actuelle, la tuberculose (TB) peut être prévenue grâce à un vaccin et, dans la plupart des cas, guérie grâce à six mois de traitements médicamenteux. Cependant, il fait toujours environ 1,5 million de vies dans le monde chaque année – et nous ne voulons pas que ce nombre aille dans la mauvaise direction.
C’est ce qui rend cette nouvelle étude, la plus grande analyse de séquençage du génome de Mycobacterium tuberculosis à ce jour, si vitale. La menace d’une souche de tuberculose résistante aux médicaments ne disparaîtra pas de si tôt.
“Notre étude démontre la capacité d’études à très grande échelle à améliorer considérablement notre connaissance des variants génétiques associés à la résistance aux antimicrobiens chez M. tuberculosis”, écrivent les chercheurs dans l’un de leurs articles publiés.
Dans la première de deux études, l’équipe a collecté et séquencé 12 289 isolats de 23 pays et les a exposés à une variété d’antimicrobiens généralement utilisés pour traiter la tuberculose. Parmi ceux-ci, plus de la moitié se sont avérés résistants à au moins un médicament, et 2 129 d’entre eux se sont avérés résistants aux médicaments les plus puissants ou à plusieurs médicaments.
Dans une expérience de suivi basée sur 10 228 isolats bactériens, les chercheurs ont trouvé des souches tolérantes, voire résistantes, à chacun des 13 antimicrobiens testés.
L’identification des seuils auxquels les médicaments commencent à affecter différentes souches pourrait déterminer la posologie la plus efficace à utiliser ou aider les spécialistes à choisir les meilleurs traitements.
Une analyse plus approfondie a identifié les 20 gènes les plus importants qui ont fourni un degré de résistance aux variants.
Les scientifiques pourront désormais suivre les gènes spécifiques qui ont été identifiés et étudier leur potentiel pour rendre la tuberculose résistante aux antibiotiques. Les nouvelles informations devraient également aider au traitement de toute souche de tuberculose.
“Le recueil de données est entièrement open source et nous espérons qu’il facilitera et inspirera les recherches futures pour les années à venir”, écrivent les chercheurs dans l’un de leurs articles publiés.
L’Organisation mondiale de la santé (OMS) souhaite améliorer les processus de diagnostic et de traitement de la tuberculose à l’échelle mondiale, et cette étude en fait partie. Beaucoup plus peut être fait : moins de la moitié des cas de tuberculose pharmacorésistante sont actuellement signalés, par exemple.
Pour bloquer la résistance aux antibiotiques, les scientifiques doivent en savoir plus sur ces cas et sur les souches qui les sous-tendent. L’équipe affirme que le travail est particulièrement important pour comprendre les effets de ce qu’on appelle les médicaments nouveaux et réutilisés (NRD) qui ont été récemment développés pour lutter contre la maladie.
À l’heure actuelle, les tests universels de sensibilité aux médicaments sont le processus utilisé pour identifier les souches résistantes, mais cela nécessite plusieurs semaines et des conditions strictement contrôlées pour fonctionner. L’analyse génétique déployée ici promet d’être beaucoup plus efficace.
« Le séquençage du génome entier (WGS) a le potentiel de révéler l’intégralité du paysage de la résistance génétique de M. tuberculosis pour un nombre quelconque de médicaments simultanément, tout en permettant un délai d’exécution plus rapide et une réduction des coûts », écrivent les chercheurs.
La recherche a été publiée dans deux articles dans PLOS Biology, ici et ici.
